Dane robocze
- Na podstawie fragmentu sekwencji DNA zidentyfikuj białko:
ACTGTTGGATGGCTCCCCAAAGAGATTCAGAAGGCAGACTTCAGGCAGACCCTCAGCGCT
TTCCTCATGGGATTCGCCAGCTAGCTAATTATGTTCACAGCAAAGGACTGAAGCTAGGGA
TTTATGCAGATGTTGGAAATAAAACCTGCGCAGGCTTCCCTGGGAGTTTTGGATACTACG - Który z wariantów blast: BLAT, BLASTN, BLASTP, BLASTX, TBLASTN, TBLASTX dostarczył najłatwiejszy do interpretacji wynik?
- Czy wyniki otrzymane po przetłumaczeniu fragmentu sekwencji DNA są porównywalne?
- Po identyfikacji przygotuj zestaw podstawowych informacji dotyczących badanego białka:
- odnośnik do wybranej bazy danych sekwencji DNA, identyfikator sekwencji, statystykę sekwencji;
- odnośnik do wybranej bazy danych sekwencji białkowych, identyfikator sekwencji, statystykę sekwencji;
- zestawienie danych fizykochemicznych badanego białka (masa kDa, pI, % skład aminokwasowy, współczynnik ekstynkcji, itp.). - Wczytaj sekwencję do programu JalView i przygotuj zestawienie kluczowych właściwości białka w formie adnotacjii właściwości (ang. annotations, features).
Skorzystaj w tym celu z danych UniProt.
Posledná zmena: Tuesday, 30 May 2023, 09:28