Tematyka
- Sekcja ogólna
- Informacje ogólne
- Projekt
Projekt
- Przygotuj raport w formacie prezentacji Sway prezentujący etapy procesu inżynierii białka w zadanej tematyce.
Plik w formacie pdf nazwij:
NR_GRUPY-NR_ALBUMU1-NAZWISKO1_IMIĘ1-NR_ALBUMU2-NAZWISKO2_IMIĘ2.pdf
np.:
P1-123456-Kowalska_Anna-654321-Kowalski_Jan.pdf
Tylko tak nazwane pliki będą zaliczane na poczet wykonania zadania!
Uwagi i zalecenia (lista będzie uaktualniana):- jakie kryteria zastosowano przy wyborze kandydatów do ETZ;
- do prezentacji sekwencji używaj czcionki o stałej szerokości (FASTA format);
- od nazwy gatunku kandydata na ETZ cenniejszy jest kod identyfikacyjny sekwencji w bazie, z której ją pobrano;
- nazwy aminokwasów pisze się z dużej litery;
- proszę dodać link do Sway'a na końcu prezentacji.
- Wykłady
Wykłady
Pliki zabezpieczone są hasłem: IBT.
Informacje (wraz z prezentacją) dotyczące AlphaFold dostępne są pod adresem https://www.ebi.ac.uk/training/events/how-interpret-alphafold-structures/.
Zagadnienia do zaliczenia:
- Cele i metody stosowane w inżynierii białek.
- Narzędzia bioinformatyczne:
- dopasowanie sekwencji, struktur
- właściwości aminokwasów a aktywność biologiczna
- identyfikacja i znaczenia domen
- modelowanie struktury białek
- Białka rekombinowane:
- projektowanie (kolejność domen np. pozycja peptydu sygnałowego, etykiety do oczyszczania)
- produkcja :
- organizmy i ich zdolności produkcyjne
- modyfikacje potranslacyjne
- oczyszczanie
- Prowadzący
Prowadzący
Łyskowski Andrzej, dr inż.
Jednostki:
KATEDRA BIOTECHNOLOGII I BIOINFORMATYKI (CB)
stanowisko: adiunkt w grupie pracowników badawczo-dydaktycznych
pokój: H.237
telefon: 17 865 1649
Informacje ogólne:
email: alyskowski@prz.edu.pl