LINK DO PRZESYŁANIA RAPORTU: Dokowanie molekularne inhibitora pompy efflux
Raport z wykonania zadania w formacie pdf powinien zawierać:
- zwięzły opis pompy efflux
- hipotezę roboczą dotyczącą działania inhibitora
- charakterystykę ligandów (antybiotyki i inhibitor)
- charakterystykę receptora
- wyniki dokowania
- interpretację wyników dokowania
Opracowanie wyników dokowania do raportu
- Załadować wyniki dokowania (plik *.pdb, File | Open, można dodać wszystkie pliki jednocześnie)
- Dopasować do siebie struktury (A | align | to molecule)
- Ukryć strukturę białka (H | cartoon)
- Pokazać _wszystkie_ zadokowane ligandy (A | state | all state)
- Wykonać analizę wyników:
- czy ligand dokuje się w jednym miejscu?
- czy antybiotyki dokują się w tym samym miejscu?
- czy antybiotyk/i dokują się w tym samym miejscu co inhibitor?
- Na podstawie obserwacji zaproponować mechanizm działania inhibitora
- Proszę zadbać by ilustracje do raportu zawierały podstawową legendę pozwalającą na interpretację (kolor 1 - ligand 1, etc.)
- Zachęcam do korzystania z AI by uzyskać instrukcje 'jak to zrobić' w PyMOL'u...
Termin zwrotu: 02.02.2026 r 12:00
Skala ocen: od 2,0 (ndst) do 5,0 (bdb)